Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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