Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CNGA3Q16281 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CNGA3Q16281 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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