Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SIX1Q15475 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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