Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSMD6Q15008 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD6Q15008 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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