Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNB1Q14721 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms