Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms