Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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