Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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