Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms