Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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