Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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