Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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