Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNL1Q0VF96 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms