Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms