Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALD1Q05682 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms