Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms