Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms