Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VBP1P61758 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms