Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS3AP61247 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms