Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM258P61165 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms