Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTBP60709 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms