Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC01547P58512 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms