Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1H2P55055 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms