Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LUMP51884 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LUMP51884 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LUMP51884 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LUMP51884 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms