Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP4P49662 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP4P49662 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms