Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF4P48230 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms