Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms