Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DCCP43146 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCCP43146 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCCP43146 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCCP43146 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCCP43146 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCCP43146 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCCP43146 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCCP43146 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCCP43146 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCCP43146 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
DCCP43146 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCCP43146 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCCP43146 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms