Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA13P31271 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA13P31271 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms