Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA9P31269 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms