Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX2P28328 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX2P28328 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX2P28328 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX2P28328 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX2P28328 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX2P28328 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms