Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms