Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms