Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA5P20719 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA5P20719 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA5P20719 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms