Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL3P19876 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms