Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRF1P14222 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRF1P14222 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRF1P14222 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PRF1P14222 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms