Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRFP10586 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRFP10586 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms