Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms