Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms