Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms