Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINC1P01008 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINC1P01008 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms