Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA3O75145 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms