Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX5O60225 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX5O60225 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms