Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDIL3O43854 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms