Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX6O43752 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX6O43752 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX6O43752 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX6O43752 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX6O43752 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms