Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms