Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms