Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASKO14936 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASKO14936 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASKO14936 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms