Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DEV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DEV8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DEV8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DEV8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DEV8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DEV8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms