Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms